苏南地区1b型丙型肝炎病毒包膜区变异进化研究

本研究旨在了解本地区丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)基因型构成的前提下,分析1b型丙型肝炎病毒包膜2(second envelope glycoprotein E2)区的变异和种系进化,并研究其准种变异与临床肝病活动度的关系。对宜兴市人民医院收集的抗HCV抗体阳性患者166名,RT-PCR方法检测HCVRNA,HCVRNA阳性患者采用型特异性引物分型法确定病毒基因型;选择其中未经干扰素治疗的43例1b型慢性丙型肝炎患者的血清标本,扩增E2区,从中选取肝硬化患者4例,慢性非肝硬化患者6例的E2区PCR产物纯化测序,序列采用CLUSTALW与GENBANK上多株不同型别的HCV序列进行比对分析,结果采用Phylip软件构建遗传进化树;并观察E2区高变区1(HVR-1)的氨基酸(aminoacid,aa)残基序列的变异特征;采用单链构象多态性垂直电泳检测43例患者个体内HCVE2区准种的变异情况,比较不同肝病活动度患者准种变异情况。结果表明本地区HCV以1b型为主(84.3%),对E2区基因序列和氨基酸序列变异的分析显示其变异具有一定的规律性,种系进化树提示本地区HCV病毒序列与上海、湖南、日本等地的HCV株有较近的亲缘性。43例患者中ALT高于正常的丙型肝炎患者准种复杂程度明显高于ALT正常者(P<0.05)。故本地区HCV基因变异符合中国东南部的特点,基因变异与临床肝病活动度具有相关性。     

四份中国HCV阳性血清中包膜蛋白E1/E2准种基因的序列分析及新型插入突变的发现

为分析四份中国丙型肝炎病毒（HCV）阳性血清中包膜蛋白E1/E2基因的准种特征。本研究对从4份中国HCV阳性血清（1b亚型：274、366、383;2a亚型：283）中提取的HCV核酸,采用逆转录-聚合酶反应扩增编码全长E1/E2蛋白（191～764aa）的基因片段,随机挑取多个克隆测序。根据E1/E2基因核苷酸的序列与其他相关序列（来自于GenBank）构建亲缘性关系进化树,进行核苷酸与氨基酸同源性分析并对重要的基因位点进行分析。共获得阳性克隆序列43个（274株10个,283株12个,366株13个,383株8个）,发现高变区HVR1、HVR2的基因异质性高,而其他抗体中和表位及跨膜区I、II及N末端糖基化位点相对保守。并首次发现在HCV 2a亚型（283血清）中多个准种序列存在1279nt（E1区,313aa）处单碱基插入优势基因突变,导致HCV包膜蛋白编码突变与中断（E2区,398aa）。本研究对中国HCV代表株包膜蛋白E1/E2编码基因的准种多样性及一种新型插入突变进行了描述,可为进一步研究HCV免疫逃避与慢性化机制提供重要信息。关键词：丙型肝炎病毒;包膜蛋白;序列分析;准种;插入突变     

内蒙古呼和浩特地区丙型肝炎病毒基因型分布

为了解内蒙古呼和浩特地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型的分布特征,为本地区丙型肝炎的治疗、预防提供基础数据资料。收集呼和浩特地区2014年1月至2015年1月就诊的门诊和住院丙型肝炎患者血清采样标本149份,均为HCV抗体检测阳性且HCVRNA定量检测阳性。QIAGEN柱式病毒RNA提取法提取HCV RNA,反转录成cDNA,巢式PCR法扩增HCVNS5B区,对扩增片段进行测序,在NCBI BLAST上进行序列比对得到相似度最大的参考序列并确定基因型,用Megalign,Clustal W进行序列分析并建立同源关系树,分析呼和浩特地区HCV感染基因型的分布特征,以及基因型与宿主性别、年龄的关系。在测序成功的94份样本中,共检出6个基因型,1b型占73.40%(69/94),2a型占19.14%(18/94),3a、3b、6a型各占2.12%(2/94),6u型占1.06%(1/94)。性别资料明确的93例样本,男女基因型分布无显著差异(P0.05)。年龄资料明确的90例HCV样本,1+2型的患病年龄高于3+6型的患病年龄有统计学意义(P0.05)。得出内蒙古呼和浩特地区HCV感染的基因型1b为主,其次为2a型,但也有3型、6型等基因型的传入。HCV的基因型4型和5型未检测到。     

丙型肝炎病毒准种血清学检测技术的建立

目的:建立一种以血清学为基础的丙型肝炎病毒(HCV)准种检测技术。方法:自20份HCV血清中各挑选30个克隆进行测序比较,分析HCV准种的复杂程度;以HCV准种代表性抗原组合制备免疫芯片,用血清学检测技术分析上述20份HCV血清中的准种变异程度;比较两种方法之间的检出灵敏度和相关性。结果:测序法检出灵敏度为70.0%,血清学检测法检出灵敏度为95.0%,后者显著高于前者(P0.05);两种方法检测结果的相关性为74.7%(P0.01)。结论:血清学检测技术操作简单,且能够反映丙型肝炎患者的HCV准种变异程度,适于临床推广。     

慢性丙型肝炎患者中丙型肝炎病毒准种变异研究进展

丙型肝炎病毒（HCV）具有较高的变异性,通常以准种的形式分布在感染者的体内,病毒容易逃离机体的免疫监控,因而无法被有效地清除,导致机体很难控制其感染的发展,故易转变成慢性肝炎。HCV准种变异在宿主体内的持续存在对病毒感染的控制、抗病毒药物和疫苗的发展都是一个巨大的挑战。,我们重点阐述近年来关于HCV准种变异及其与慢性丙型肝炎患者的机体免疫、疾病进展、治疗效果之间关系的研究进展。     

皖南地区丙型肝炎病毒治疗前后HVR1区碱基变异数量的研究

目的研究皖南地区丙型肝炎病毒治疗前后高变区1(HVR1)碱基变异数量与病情变化和治疗效果之间是否具有相关性。方法应用速率法和荧光定量PCR法,检测皖南地区141例慢性丙型肝炎患者血清ALT水平和HCV RNA的载量。应用RT-PCR法进行HCV基因型和治疗前后的HVR1区域序列的检测。结果 141例患者的血清ALT与HCV RNA两指标间采用Spearman等级相关分析显示,rs=0.213,P=0.011,差异具有统计学意义,存在正相关。通过HCV基因1型、2型和未分型3组的HVR1碱基变异数量的单因素方差分析,显示组与组之间差异具有统计学意义。结论慢性丙型肝炎患者治疗前后的HVR1序列碱基变异数量的分析,对治疗效果、病情变化及预后发展等方面的评估具有重要的指导意义。     

502例丙型肝炎患者病毒基因分型及与性别和年龄的关系研究

目的:探讨502例丙型肝炎患者病毒基因分型的情况,分析其与性别和年龄的关系,为丙型肝炎的防治提供参考。方法:收集贵州地区502例丙型肝炎患者的血液标本,采用PCR-荧光探针法检测丙型肝炎病毒基因型,并对检测数据进行统计学分析。结果:共检出4种基因型及5种基因亚型,主要以1b型、3b型为主,其次是6a、3a型,2a型较少。不同性别丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布比较,差异有统计学意义(x²=11.029,P=0.026),男、女性患者均以1b型、3b型为主要基因型,但男性感染者明显多于女性。各个年龄组HCV基因型分布比较,差异有统计学意义(x²=102.946,P=0.000),40-59岁组感染者最多,以1b型为主,其次是20-39岁组,以3b型为主,≥60岁组感染人数较少,以1b型为主。结论:贵州地区HCV呈现多基因型分布,1b、3b型为主要流行基因型,6a、3a型次之,其余基因型较少,不同性别、年龄的HCV基因型分布存在差异性。     

吉林省延边地区丙型肝炎病毒基因型分布

为了解延边地区不同丙型肝炎病毒(HCV)基因型的分布特点,应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,检测了48例本地区抗HCV阳性血清,结果有29例出现HCVRNA阳性.再利用限制性片段长度多态性(RFLP)技术,对29例RT-PCR阳性标本进行HCV基因分型.结果延边地区主要流行HCVⅡ型,其次是HCVⅢ型,也存在HCVⅡ/Ⅲ混合型,且HCVⅢ型的感染率较高.     

HCV准种单链构象多态现象的检测

单链构象的多态现象(SSCP)是根据PCR技术广泛用于检测不同DNA序列的一门技术，由遗传学家开发的致突变检测，最近已采用于病毒基因组准种的分析，如丙型肝炎病毒(HCV)。由于该技术严格的标准化及其检测的局限性使之很难推广，HCV高变异区准种内的变异体被克隆到Puc　119，引起质粒定量，这种变种可用作SSCP最佳模板，所研究的变量有许多检测到的变异体，少数变异体检测的敏感性，电泳温度、单链DNA产生的方法、PCR循环次数的影响以及与校读能力有关的DNA多聚酶的应用。结果表明，它是能在准种内至少测出5种变异体的最佳方法，并能检出低至2％水平的准种内的变异体，电泳在室温18小时其重复性最好，使用Taq多聚酶单个引物作20次循环产生的单链DNA给准种构成一个精确的映象，Pfu多聚酶的应用减低了检测较小的带型的敏感性。SSCP法提供了评价HCV准种一个精确的工具。     

丙型肝炎病毒准种及其临床意义研究进展

丙型肝炎病毒（HCV）易发生变异,在宿主体内主要以准种形式存在。HCV准种能够参与病毒逃避宿主的免疫监控及抗病毒治疗的耐药性,导致病毒在宿主体内持续存在,形成慢性感染。该文就HCV准种的产生、研究方法、基因组各区段内准种的研究及其临床意义作一综述。     

Characteristics of the membranes of the pellicle of the ciliatePseudomicrothorax dubius

Summary The membranes of the pellicle of the ciliatePseudomicrothorax dubius are investigated using thin section electron microscopy and freeze-fracture replicas. The plasma membrane is covered by a surface coat and is connected to the outer alveolar membrane by short, sometimes branched, bridges. The inner alveolar membrane is coated on both sides. The epiplasm lies in intimate contact with the cytoplasmic surface of this membrane, and there is a corresponding deposit on the other surface. This deposit is regularly striated.The epiplasmic layer and the alveoli are interrupted at sites of cytotic activity,e.g., the attachment sites of trichocysts, the cytoproct, and the parasomal sacs. The striated deposit ends where the epiplasm ends, indicating a direct relationship between these two epimembranous layers.There is a deposit along the sides of the first part of the tip of the trichocysts, and in this region the trichocyst membrane is free of intramembranous particles.The membrane of the parasomal sacs has a coat on both surfaces. That on the extraplasmic surface is similar to the surface coat of the plasma membrane. The origin of the cytoplasmic coat is unknown. The cytotic activity of these sacs is indicated by their highly irregular profiles.     

The early development of the tail and the transformation of the shape of the nucleus of the spermatid of the domestic fowl,Gallus gallus

Summary The differentiation of the spermatid, especially in reference to the formation of the flagellum, and transformation of the shape of the nucleus was investigated in the domestic fowl.In the early stage of the spermatid, a prominent Golgi apparatus appears around the centrioles. The Golgi vesicles then surround the axial-filament complex which develops from the distal centriole. These vesicles fuse to form continuous membrane at the earliest stage of flagellar formation, and in the succeeding stage Golgi lamellae are attached to the plasma membrane of the developing flagellum. From these observations, it is assumed that Golgi apparatus may be a source of the membrane system of the flagellum.The microtubules distributed around the nucleus form the circular manchette. The anterior region of the nucleus with the manchette is cylindrical in shape and the posterior region without it remains irregular in shape. When the circular manchette has been completed, the whole nucleus acquires a slender cylindrical shape. The circular manchette then changes into the longitudinal manchette. The nuclei of spermatids without a longitudinal manchette are abnormal in shape. In view of these observations it is assumed that the nuclear shaping of the spermatid may be accomplished by circular manchette and the maintenance of shape of the elongated nucleus by longitudinal manchette.The authors wish to thank Mr. Takayuki Mori for his helpful suggestions and technical advices     

Separation of the pineal vesicle from the wall of the third ventricle during the post-hatching development of the chicken

Summary According to light- and electron-microscopic observations the pineal organ of the 3-day-old chicken consists of a prominent end vesicle and a tapering parenchymal stalk. During this stage the pineal lumen is in open communication with the third ventricle. However, in the 40-day-old chicken, which still possesses a well-developed end vesicle, the proximal portion of the pineal stalk displays regressive changes leading to local fragmentation. At this stage the pineal stalk is reduced, and the pineal lumen is missing. In 1-year-old chickens the parenchyma of the proximal portion of the stalk is further diminished, and in 3-year-old domestic fowl is completely displaced by bundles of collagenous fibers, only some nerve fibers being present. This post-hatching pineal development may reflect the sequence of changes leading from pineal sense organs to pineal glands.This work was supported by a grant-in-aid for Scientific Research from the Ministry of Education, Science and Culture of Japan