人造血转录因子GATA-1的克隆、表达及其对间质细胞的生物学作用

目的:构建人GATA-1全长过表达载体,对其进行过表达,并初步探讨其在人非造血细胞(人脐静脉内皮细胞、人成纤维细胞)中的生物学作用。方法:以人脐带血cDNA为模板,采用高保真PCR获得GATA-1的CDS序列,连接至pGEM-T Easy载体,构建pBPLV-GATA1慢病毒表达质粒,并对上述载体进行NheⅠ、XbaⅠ双酶切和测序鉴定,鉴定正确后,在293T细胞中进行慢病毒包装,浓缩病毒后,对我们原代分离培养的人脐静脉内皮细胞和成纤维细胞进行慢病毒感染,采用流式分选对阳性目的细胞进行纯化,阳性细胞扩增后进行Western印迹鉴定;以人包皮成纤维细胞(HFF)为研究对象,在光学及荧光显微镜下观察细胞形态变化情况,CCK-8法检测细胞增殖情况,流式细胞术检测细胞表面标志表达情况。结果:双酶切和测序结果表明克隆了1242 bp的人GATA-1全长CDS序列,经Western印迹检测,GATA-1在293T细胞中获得瞬时表达;获得了人GATA-1稳转细胞株,对稳转细胞株的检测表明,GATA-1对HFF细胞增殖具有一定的抑制作用,但对HFF细胞形态及细胞表面标志CD90、CD29的表达无明显影响。结论:构建了人GATA-1慢病毒表达载体及其稳转细胞株,GATA-1蛋白对间质细胞的增殖有一定的抑制作用。     

酵母双杂交系统筛选GATA-1相互作用蛋白质及功能验证

目的 利用酵母双杂交技术从人脑cDNA文库中筛选与人GATA-1相互作用的蛋白质.方法 从人K562细胞中扩增出全长GATA1基因,设计引物将其3段截断体亚克隆入酵母表达载体pDBLeu中,转化至AH109感受态酵母中,利用酵母双杂交技术筛选人脑cDNA文库中与其相互作用的蛋白质,阳性克隆通过回转及免疫共沉淀试验进行验证,利用3xGATA荧光素酶报告基因对相互作用蛋白质进行功能验证.结果 成功构建出酵母诱饵蛋白表达质粒pDBLeu-GATA1（1）,pDBLeu-GATA1（2）,pDBLeu-GATA1（3）,筛到34个阳性克隆,用生物信息学分析及回转验证得到5个与GATA-1相互作用的候选蛋白,通过免疫共沉淀试验进一步验证,获得3个蛋白质能与GATA-1相互作用,分别是ECSIT,EFEMP1和GPS2.荧光素酶试验表明这3个蛋白质均能对GATA1的转录活性产生影响,证实它们之间的相互作用具有影响GATA1转录的功能.结论 应用酵母双杂交技术及免疫共沉淀试验,从人脑cDNA文库中成功获得3个与GATA-1相互作用并对其转录活性具有调节作用的蛋白质,为研究GATA1蛋白质的功能提供了新的线索.     

非洲爪蟾GATA-1b中与GATA-1a的差异位点突变后的功能

非洲爪蟾GATA 1因子分为GATA 1a和GATA 1b两种亚型。与其他种类的GATA 1因子相类似 ,GATA 1是红细胞分化成熟所必需的因子之一。二种亚型在造血方面具有同样的作用 ,但只有xGATA 1b具有抑制神经发生的功能。比较二者的结构 ,发现二者的核酸和蛋白质结构虽然都非常相似 ,但并不完全一致。为探讨这些差异结构与功能之间的关系 ,我们对xGATA 1b中与xGATA 1a差异的Ser1 6 8和His1 6 9位点进行缺失突变 ,并定点突变Thr30 4和Thr359位点。之后将体外制备好的野生型或突变型xGATA 1bmRNA单独或与DN BRmRNA共同导入非洲爪蟾 2细胞胚胎内 ,利用动物帽系统分析突变体在神经发生和造血方面的功能。结果发现 ,Ser1 6 8和His1 6 9以及Thr359位点突变后 ,xGATA 1b再不能抑制DN BR诱导的神经发生 ;但所有突变都未影响xGATA 1b在造血方面的功能。由此 ,我们首次证实了Ser1 6 8和His1 6 9以及Thr359位点可能是导致xGATA 1b和xGATA 1a之间功能分离的结构基础之一。     

转录因子GATA-2在脊椎动物发育过程中的作用

GATA-2是对外胚层和中胚层发育至关重要的转录因子,它属于具有保守锌指结构的GATA转录因子家族.GATA家族包括6个成员:分别命名为GATA-1～GATA-6.最新研究表明,GATA-2不仅存在于胚胎器官,还对成体造血细胞系、神经系统、垂体和泌尿生殖系统中细胞的功能和维持都必不可少.本文旨在通过对GATA-2的功能研究进展进行综述,探讨GATA-2在生殖系统中的作用机制,以期更广泛地了解GATA-2基因在生物发育过程中的作用及对相关基因的调控机制,从而为攻克人类相关疾病提供理论依据.     

转录因子GATA-4在心肌分化、肥厚及凋亡中的作用

锌指结构家族成员GATA-4作为一种特定的细胞核转录因子,涉及基因调节的不同环节,控制着基因的表达和功能的调节,正日益受到高度重视.该文系统阐述了GATA-4因子的结构、表达及其在心脏发育、心肌肥厚和抗心肌细胞凋亡方面的作用.     

Lyl1不同转录本在斑马鱼原始造血中的作用

原始造血是生物体内至关重要的发育过程,其产生的血液细胞不仅在早期胚胎时期负责氧气和营养物质的运输,同时也为免疫系统发育奠定了基础。在原始造血过程中,造血相关转录因子及其辅因子相互作用形成复杂的调控网络,共同调控原始造血的发生与成熟。其中,bHLH转录因子家族中的SCL和LYL1在胚胎造血中起着核心作用。SCL参与原始造血的启动,而LYL1则被认为是SCL的旁系同源,能够在成年后SCL缺失时弥补其对造血的影响。然而,目前LYL1在原始造血中的具体作用尚不明确。本研究通过分析斑马鱼血液细胞单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,发现CABZ01066694.1在造血干/祖细胞中高表达。序列比对显示,CABZ01066694.1是lyl1基因的一种短型转录本。本研究通过5′端快速扩增的cDNA末端测序(5′RACE)验证了斑马鱼和人类的lyl1基因均存在长型转录本(lyl1f)和短型转录本(lyl1s)。进一步通过分析公共数据库中的scRNA-seq和RNA-seq数据,发现在斑马鱼原始造血细胞中,lyl1主要转录lyl1s。最后,本研究通过Morpholino技术分别敲低lyl1f和lyl1s,发现lyl1s的敲低显著抑制了原始髓系祖细胞和原始粒系细胞的产生,而lyl1f的敲低则促进了原始巨噬细胞的生成。综上所述,本研究揭示了斑马鱼源lyl1和人源LYL1均存在长、短型转录本,并且这两种转录本在调控原始髓系的发生过程中具有不同作用,为理解原始造血的分子调控提供了新的线索。     

转录因子PU.1在髓系造血中的作用及研究进展

目前研究证明,转录因子PU.1是骨髓基因的主要调控元件。PU.1的结构、表达调控等在骨髓造血中起重要作用。本文简要描述PU.1的结构,特异性表达及调控,并着重描述PU.1在血细胞生成过程中作用的研究进展。     

WT1基因在转录调控中的作用

ＷＴ１基因于１９９０年发现,在某些组织中特异表达,它的蛋白质产物在转录调控中起一种双向转录因子作用。它自身表达也受很多因素的调控。西方综述了近年来国内外关于ＷＴ１基因在转录调失方面的作用的研究进展。     

Nrf2 信号通路及其在肝组织中的作用

肝脏是一个多方面高度调节的防御性器官,能够抵御多种化学/ 氧化应激,而在这个防御系统的最前线是一群被称作转录因子的特殊蛋白,这些蛋白能识别并结合于特异性基因启动子区域中特异的DNA 元件,从而调节多种细胞保护性基因的基础型和诱导型表达,发挥细胞保护作用。而转录因子NF-E2 相关因子2（Nrf2）是细胞防御化学/ 氧化应激的重要调节因子之一。综述Nrf2 信号通路中主要调控因子的相互作用、Nrf2 的激活与失活机制以及Nrf2 信号通路在肝组织中的作用。     

锌指亚家族GATA-4、-5和-6的调控作用

GATA蛋白是一类重要的转录调节因子,它们具有保守的DNA结合结构域,其中的GATA 4、 5和 6亚家族对组织特异性基因的表达起关键性的调控作用.综述了这3种因子的结构功能,在小鼠中的表达模式和基因定位,在组织特异性基因表达中的作用,对可诱导基因表达的调节以及与它们相互作用的有关因子等.     

应用蛋白组方法筛选血浆中乙肝病毒PreS1结合蛋白

目的筛选血浆中乙型肝炎病毒PreS1结合蛋白。方法表达纯化了PreS1-谷胱甘肽-S-转移酶（glutathione—S-transferase,GST）融合蛋白,利用该蛋白与血浆进行Pull—down实验,并设立GST与血浆Pull—down,GST、PreS1-GST与PBS Pull—down对照,Pull-down产物进行双向电泳分离（2-DE）,差异蛋白点通过质谱鉴定。结果成功表达纯化出PreS1-GST融合蛋白,通过双向电泳分析发现一个PreS1特异结合蛋白,经质谱鉴定为含锚蛋白重复序列的蛋白57（ANKRD57）。结论锚蛋白重复序列的主要功能是介导蛋白质与蛋白质之间的相互作用,ANKRD57与PreS1特异结合后的生理功能值得深入研究。     

Zinc Finger-like Motif Conserved in a Family of RNA Binding Proteins

NP220s compose a family of RNA binding proteins together with matrin 3, one of major proteins of the nuclear matrix. They have repeats of RNA recognition motif (RRM; MH2) homologous to RRM in heterogeneous nuclear RNPs I/L in addition to MH1 and MH3 with unknown function. In search of additional homologous sequences, we found the reported sequence of rat matrin 3 is partially incorrect. Correction of this sequence showed that the NP220 family has a fourth homologous motif with the characteristics of a Cys₂-His₂ zinc finger-like motif. The sequence of this motif is perfectly conserved in human and mouse NP220s despite their 75% overall sequence homology.     

C2H2型锌指蛋白的研究进展

锌指基因家族是人体中最大的基因家族,它参与细胞分化、胚胎发育,并与许多疾病的发生相关．根据半胱氨酸(c)和组氨酸(H)的数目和位置可将锌指蛋白分为c2H2、c2Hc2、c2c2 CHCC2C2、C2C2C2C2等亚类．c2H2型锌指是最普遍的类型,它们作为重要的转录调控因子参与许多的生理过程．c2H2型锌指蛋白包含的锌指数目从1个到30多个不等．依据锌指的数量以及在蛋白中的分布情况,大多数c2H2型锌指蛋白属于下列3类之一：1)含3个c：H：锌指的蛋白(tC2H2);2)含多个锌指的c2H2型锌指结构蛋白(mac2H2);3)锌指成对间隔排列的c2H2型锌指蛋白(spC2H2)、一些c2H2型锌指蛋白能识别并结合特异性RNA或DNA片段．另一些则只能与RNA结合．通常锌指蛋白含锌指数目越多。它选择结合的能力就越强．     

Role of Conserved Residues of the WRKY Domain in the DNA-binding of Tobacco WRKY Family Proteins

Four cDNA clones of tobacco that could code for polypeptides with two WRKY domains were isolated. Among four NtWRKYs and other WRKY family proteins, sequence similarity was basically limited to the two WRKY domains. Glutathione S-transferase fusion proteins with the C-terminal WRKY domain of four NtWRKYs bound specifically to the W-box (TTGACC), and the N-terminal WRKY domain showed weaker binding activity with the W-box compared to the C-terminal domain. The DNA-binding activity of the WRKY domain was abolished by o-phenanthroline and this inhibition was recovered specifically by Zn²⁺. Substitution of the conserved cysteine and histidine residues of the plant-specific C₂H₂-type zinc finger-like motif in the WRKY domain abolished the DNA binding. In addition, mutations in the invariable WRKYGQK sequence at the N-terminal side of the zinc finger-like motif also significantly reduced the DNA-binding activity, suggesting that these residues are required for proper folding of the DNA-binding zinc finger.