| 我国近海龟足3个地理群体比较转录组及环境适应性研究 |
| |
| 引用本文： | 毛宁,蔡月凤,张宇,姬南京,申欣.我国近海龟足3个地理群体比较转录组及环境适应性研究[J].动物学杂志,2023,58(4):563-578. |
| |
| 作者姓名： | 毛宁 蔡月凤 张宇 姬南京 申欣 |
| |
| 作者单位： | 江苏海洋大学，江苏省海洋生物资源与环境重点实验室/江苏省海洋生物技术重点实验室 连云港 222005;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心 连云港 222005 |
| |
| 基金项目： | 江苏省杰出青年基金项目(No. BK20190048)，国家自然科学基金项目(No. 41876147)，江苏省重点学科发展计划和研究生研究与实践创新计划项目(No. KYCX21_3136)； |
| |
| 摘 要： | 龟足(Capitulum mitella)隶属于节肢动物门(Arthropoda)指茗荷科(Pollicipedidae)龟足属，广泛分布于亚热带及热带近海沿岸中高潮地带。由于龟足生存环境复杂多变，可能导致其不同地理群体形成与其生境相适应的特征。本研究基于高通量测序技术对浙江舟山、福建宁德和广东珠海3个典型海域的龟足进行比较转录组分析，并利用生物信息学方法探究3个地理群体对环境的适应机制。结果表明，3个地理群体间存在651个(广东珠海和福建宁德群体间)至3 738个(浙江舟山和福建宁德群体间)数量不等的差异表达基因(DEGs)，主要涉及核糖体合成、抗原加工与递呈、分子伴侣代谢通路。基因序列的非同义替换率(Ka)和同义替换率(Ks)之间的比例Ka/Ks，如果其超过1，则认为有正选择压力作用于该基因，基因正在快速进化。3个地理群体间龟足直系同源基因正选择压力分析结果显示，254个直系同源基因中有7个基因受到正选择压力，包括D-天冬氨酸酶基因(Ka/Ks=2.0...
|
| 关 键 词： | 龟足 地理群体 比较转录组 环境适应性 |
| 收稿时间： | 2022/11/10 0:00:00 |
|
| 点击此处可从《动物学杂志》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《动物学杂志》下载全文 |
|
