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猪CAPN1基因部分外显子及3'UTR区的SNPs检测
引用本文:杨秀芹,刘慧,郭丽娟,关庆芝,许尧,刘娣.猪CAPN1基因部分外显子及3'UTR区的SNPs检测[J].遗传,2008,30(6).
作者姓名:杨秀芹  刘慧  郭丽娟  关庆芝  许尧  刘娣
基金项目:黑龙江省杰出青年科学基金,黑龙江省科技攻关项目
摘    要:以野猪.民猪和大白猪为研究对象,根据网上公布的序列设计了7对引物,采用测序,PCR-SSCP和PCR-RFLP方法对CAPN1基因的部分外显子和3'UTR区进行了单核苷酸多态性检测和基因型分析,探讨CAPN1基因多态性与瘦肉率和嫩度的关系.研究发现11个SNPs,其中5个位于外显子,4个位于内含子,2个位于3'UTR区,外显子中的突变有一处是错义突变,导致了蛋白质多肽链第260位氨基酸发生了M/V的替代.群体遗传学分析表明,在所检测的各多态位点上,野猪、民猪、大白猪3个品种间不同基因型的分布都存在着极显著的差异(P<0.01),而野猪和民猪之间各基因型的分布差异不显著(P>0.05),民猪和大白猪之间各基因型的分布存在着极显著的差异(P<0.01).结合品种特性分析表明,P4、P6引物和3'UTR区Hinf1位点所检测的不同基因型和瘦肉率具有一定的相关性.

关 键 词:  CAPN1基因  瘦肉率  嫩度

Analysis of SNPs in partial exons and 3' UTR of CAPN1 in porcine
YANG Xiu-Qin,LIU Hui,GUO Li-Juan,Guan Qing-Zhi,XU Yao,LIU Di.Analysis of SNPs in partial exons and 3' UTR of CAPN1 in porcine[J].Hereditas,2008,30(6).
Authors:YANG Xiu-Qin  LIU Hui  GUO Li-Juan  Guan Qing-Zhi  XU Yao  LIU Di
Abstract:
Keywords:PCR-SSCP  PCR-RFLP
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