| 群体遗传学研究中的数据处理方法Ⅰ.RAPD数据的AMOVA分析 |
| |
| 引用本文： | 张富民,葛颂.群体遗传学研究中的数据处理方法Ⅰ.RAPD数据的AMOVA分析[J].生物多样性,2002,10(4):438-444. |
| |
| 作者姓名： | 张富民 葛颂 |
| |
| 作者单位： | 中国科学院植物研究所系统与进化植物学重点实验室,北京,100093 |
| |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划)，国家自然科学基金 |
| |
| 摘 要： | 近年来，RAPD数据和AMOVA分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而，由于RAPD标记具显性特点，加上目前进行AMOVA分析所依赖的RAPDistance软件不完善，使得对RAPD数据进行AMOVA分析时存在许多不足。本文介绍了AMOVA分析的基本过程，同时引入一个新的程序DCFA用以替代RAPDistance，并详述了将DCFA与WINAMOVA联用，对RAPD数据进行AMOVA分析的具体步骤与注意事项。最后，以产自中国和巴西8个普通野生稻（Oryza rufipogon）天然群体为例，演示了对RAPD表型数据进行AMOVA分析的过程，讨论了AMOVA分析结果在群体遗传结构上的意义。通过对AMOVA算法的分析，同时比较4种距离系数所得AMOVA结果，我们认为在进行AMOVA分析时选择NEILI距离和欧氏距离平方较为合适，而目前国内使用较多的JACCARD系数不适合AMOVA分析。
|
| 关 键 词： | 群体遗传结构 RAPDistance DCFA 进化距离 |
| 收稿时间： | 2002-5-20 |
| 修稿时间： | 2002-9-29 |
Data analysis in population genetics.Ⅰ. Analysis of RAPD data with AMOVA |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | RAPDistance DCFA |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《生物多样性》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《生物多样性》下载全文 |
