| 基于棉花参比种质的SSR多态性核心引物筛选 |
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| 引用本文： | 潘兆娥,孙君灵,王西文,贾银华,周忠丽,庞保印,杜雄明.基于棉花参比种质的SSR多态性核心引物筛选[J].生物多样性,2008,16(6):555-561. |
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| 作者姓名： | 潘兆娥 孙君灵 王西文 贾银华 周忠丽 庞保印 杜雄明 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院棉花研究所/农业部棉花遗传改良重点开放实验室,河南安阳,455000 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划
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国家重点基础研究发展规划(973计划)
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| 摘 要： | 棉花品种间遗传多样性的评价和遗传图谱构建都需要大量多态性的SSR标记。本研究通过构建棉花参比种质(panel), 高效快速地筛选出棉花多态性核心引物。本实验选用12份表型性状和遗传差异较大的棉花种质作为参比种质, 对来自Cotton Microsatellite Database (CMD)网站上 (http://www.cottonssr.org) 的5,914对棉花SSR引物进行了PCR扩增。结果表明: 在不同棉种间多态性的引物有4,800对, 约占有效扩增引物(5,300对)的90.6%; 能区分不同品种间差异的引物大约有500对, 占有效扩增引物的9.4%。我们推荐其中319对扩增效果好、条带清晰的引物作为棉花种质资源鉴定和分子指纹分析的核心引物, 其中277对能把陆地棉品种间的差异鉴别出来。此外, 我们还找到了在陆地棉、海岛棉及亚洲棉三大栽培棉中都有差异的13对共同SSR引物, 建议作为分子指纹分析和种质鉴定的首选引物。本研究公开了319对核心SSR引物及其多态性信息, 有利于规范引物筛选程序、提高引物筛选效率, 对棉花种质资源的遗传多样性分析、指纹图谱构建, 以及种子真伪性和纯度的鉴定等都具有现实意义。
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| 关 键 词： | 棉花 引物 多态性 |
Screening of SSR core primers with polymorphism on a cotton panel |
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| Zhao-E Pan,Junling Sun,Xiwen Wang,Yinhua Jia,Zhongli Zhou,Baoyin Pang,Xiongming Du.Screening of SSR core primers with polymorphism on a cotton panel[J].Biodiversity Science,2008,16(6):555-561. |
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| Authors: | Zhao-E Pan Junling Sun Xiwen Wang Yinhua Jia Zhongli Zhou Baoyin Pang Xiongming Du |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | SSR |
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