铜鱼线粒体控制区的序列变异和遗传多样性 |
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引用本文: | 袁娟, 张其中, 李飞, 朱成科, 罗芬. 铜鱼线粒体控制区的序列变异和遗传多样性[J]. 水生生物学报, 2010, 34(1): 9-19. |
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作者姓名: | 袁娟 张其中 李飞 朱成科 罗芬 |
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作者单位: | 1.西南大学生命科学学院水产科学重庆市市级重点实验室三峡库区生态环境教育部重点实验室, 重庆 400715 2. 暨南大学水生生物研究所, 广州 510632 3. 第三军医大学中心实验室, 重庆 400038 4. 宁德高等师范专科学院生物系, 宁德 352100 |
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基金项目: | 重庆市重大科技攻关项,三峡库区生态环境教育部重点实验室基金 |
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摘 要: | 采用PCR和DNA测序技术研究长江中上游野生铜鱼的遗传多样性和群体遗传学特征,从9个采样点共获得100尾铜鱼,用于分析的线粒体DNA控制区的片段序列为946bp。在100个序列中,共检测出变异位点47个(其中增添/缺失位点8个),单倍型41种。9个地理群体的平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.9257±0.0162和0.004178±0.002337,表现出较贫乏的遗传多样性。群体间的分化指数(FST值)、平均基因流(Nm)、分子方差分析(AMOVA)和平均K2-P遗传距离均表明9个铜鱼地理群体间存在广泛的基因交流,未明显发生群体遗传分化。另外,共享单倍型比例较高,约为34%(14/41)。单倍型的UPGMA分子系统树和简约网络图显示单倍型的聚类与地理分群没有相关性。上述结果表明9个铜鱼地理群体属于同一种群。
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关 键 词: | 铜鱼 线粒体控制区 遗传多样性 |
收稿时间: | 2008-07-18 |
修稿时间: | 2009-03-12 |
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